EBГEHИЙ ДУБPOBИH [Группа СЗМ]

Эта страница только для чтения. Вы можете посмотреть исходный текст, но не можете его изменить. Сообщите администратору, если считаете, что это неправильно.
====EBГEHИЙ ДУБPOBИH====
{{:me9.jpg?100|}}\\
Доктор физ.-мат. наук, 2018\\
Старший научный сотрудник, физический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова\\
**Нaучные интеpесы:** Скaнирующая зoндовая микрoскопия нуклеинoвых кислoт, белкoв, нуклеиновo-белкoвых комплексoв, вирусов и бактерий. Изучение самoорганизации биопoлимеров на поверхнoсти\\
**Электронная почта**\\
{{:addr3.jpg?200 |}}\\
===Нaгpады:===
Лауреат конкурса "Грант Москвы - 2001" в области естественных наук\\
Cтипендия Президента РФ для аспирантов - 2004/2005\\
Лауреат конкурса "Грант Москвы - 2005" в области наук и технологий в сфере образования\\
Стипендия компании LG Chem для аспирантов - 2006\\
Премия Европейской Академии для молодых российских учёных, 2009\\
Стипендия Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, 2010, 2012, 2013\\
Лауреат конкурса грантов Президента РФ для молодых учёных, 2010-2011 и 2013-2014\\
===Список публикаций===
  - E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, T.E. Schäffer. Evidence of (anti)metamorphic properties of modified graphitic surfaces obtained in real time at a single-molecule level. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2020, 193, 111077. [[https://doi.org/10.1016/j.colsurfb.2020.111077|DOI]]
  - A.P. Tolstova, E.V. Dubrovin. Influence of Pixelization on Height Measurement in Atomic Force Microscopy. Ultramicroscopy, 2019, 207, 112846. [[https://doi.org/10.1016/j.ultramic.2019.112846|DOI]]     
  - A.S. Erofeev, P.V. Gorelkin, D.V. Kolesov, G.A. Kiselev, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Label-free sensitive detection of influenza virus using PZT discs with a synthetic sialylglycopolymer receptor layer. Royal Society Open Science, 2019, 6, 190255. [[https://doi.org/10.1098/rsos.190255|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, T.E. Schäffer, and D.V. Klinov. In Situ Single-Molecule AFM Investigation of Surface-Induced Fibrinogen Unfolding on Graphite. Langmuir, 2019, 35, 9732-9739. [[https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.9b01178|DOI]]
  - N.A. Barinov, I.I. Vlasova, A.V. Sokolov, V.A. Kostevich, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. High-resolution atomic force microscopy visualization of metalloproteins and their complexes. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2018, 1862, 2862-2868. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2018.09.008|DOI]]
  - A.M. Varizhuk, A.D. Protopopova, V.B. Tsvetkov, N.A. Barinov, V.V. Podgorsky, M.V. Tankevich, M.A. Vlasenok, V.V. Severov, I.P. Smirnov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, G.E. Pozmogova. Polymorphism of G4 associates: from stacks to wires via interlocks. Nucleic Acids Research, 2018, 46, 8978-8992. [[http://dx.doi.org/10.1093/nar/gky729|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, D.V. Klinov. High resolution atomic force microscopy visualization of fibrinogen unfolding on modified graphite. Microscopy and Microanalysis, 2018, 24, S1, 1236-1237. [[http://dx.doi.org/10.1017/S1431927618006669|DOI]]
  - N.A. Barinov, A.P. Protopopova, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. Thermal denaturation of fibrinogen visualized by single-molecule atomic force microscopy. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2018, 167, 370-376. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2018.04.037|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, M. Schächtele, D.V. Klinov, and T.E. Schäffer. Time-lapsed single biomolecule atomic force microscopy investigation on modified graphite in solution. Langmuir, 2017, 33, 10027-10034. [[http://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.7b02220|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, M. Schächtele, and T.E. Schäffer. Nanotemplate-directed DNA segmental thermal motion. RSC Advances, 2016, 6, 79584-79592. [[http://dx.doi.org/10.1039/C6RA14383K|DOI]]
  - N.A. Barinov, V.V. Prokhorov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. AFM visualization at a single-molecule level of denaturated states of proteins on graphite. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2016, 146, 777-784. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2016.07.014|DOI]]
  - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. Effect of DNA bending on transcriptional interference in the systems of closely spaced convergent promoters. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2016, 1860, 2086–2096. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2016.06.026|DOI]]
  - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, A.P. Tolstova, N.V. Kuzmina, T.V. Laptinskaya, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. A hypothetical hierarchical mechanism of self-assembly of Escherichia coli RNA polymerase σ<sup>70</sup> subunit. Soft Matter, 2016, 12, 1974-1982. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5SM02934A|DOI]]
  - P.V. Gorelkin, A.S. Erofeev, G.A. Kiselev, D.V. Kolesov, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Synthetic sialylglycopolymer receptor for virus detection using cantilever-based sensors. The Analyst, 2015, 140, 6131-6137. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5AN01102G|DOI]]
  - А.П. Толстова, Е.В. Дубровин, О.Н. Королёва. Исследование зависимости структуры σ<sup>70</sup>-субъединицы РНК-полимеразы //Escherichia coli// от ионной силы методом молекулярной динамики. Биофизика, 2015, 60, 1045–1049. [[http://dx.doi.org/10.1134/S0006350915060251|DOI]]
  - Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, А.М. Егоров, В.Г. Григоренко, И.В. Яминский. Применение атомно-силовой микроскопии для 3D-анализа результатов гибридизации нуклеиновых кислот на микрочипах.  Acta naturae, 2015, 7, 117-124. [[http://www.actanaturae.ru/attachment.aspx?id=2135|PDF]]
  - E.V. Dubrovin, S. Speller, I.V. Yaminsky. Statistical analysis of molecular nanotemplate driven DNA adsorption on graphite. Langmuir, 2014, 30, 15423–15432. [[http://dx.doi.org/10.1021/la5041773|DOI]]
  - Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, В.Г. Григоренко, А.И. Иванин, А.М. Егоров, И.В. Яминский. Применение сканирующей зондовой микроскопии в решении задач молекулярной диагностики. Биомедицинская химия, 2014, 60, 543-547.
  - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. The Model of Amyloid Aggregation of //Escherichia coli// RNA Polymerase σ<sup>70</sup> Subunit Based on AFM Data and In Vitro Assays. Cell Biochemistry and Biophysics, 2013, 66, 623-636. [[http://dx.doi.org/10.1007/s12013-012-9507-2|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, A.V. Popova, S.V. Kraevskiy, S.G. Ignatov, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky, N.V. Volozhantsev. Atomic Force Microscopy Analysis of the //Acinetobacter baumannii// Bacteriophage AP22 Lytic Cycle. PLOS ONE, 2012, 7(10): e47348. [[http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0047348|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, O.N. Koroleva, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. AFM study of //Escherichia coli// RNA polymerase σ<sup>70</sup> subunit aggregation. Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine, 2012, 8, 54-62. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.nano.2011.05.014|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, G.N. Fedyukina, S.V. Kraevsky, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky and S.G. Ignatov. AFM Specific Identification of Bacterial Cell Fragments on Biofunctional Surfaces. The Open Microbiology Journal, 2012, 6, 22-28. [[http://dx.doi.org/10.2174/1874285801206010022|DOI]]
  - М.В. Архипенко, Е.К. Петрова, Н.А. Никитин, А.Д. Протопопова, Е.В. Дубpовин, И.В. Яминский, Н.П. Родионова, О.В. Карпова, И.Г. Атабеков. Искусственные вирусоподобные частицы, полученные in vitro из белка оболочки Х-вируса картофеля и чужеродных вирусных РНК. Acta Naturae, 2011, 3, 47-53. {{:actanaturae_rus.pdf|Полнотекстовая версия (pdf)}}
  - И.В. Яминский, П.В. Горелкин, Е.В. Дубpовин. Наноаналитика для медицины. Биофизика, 2011, 56, 955-960.
  - Ю.М. Ефремов, Д.В. Багров, Е.В. Дубpовин, К.В. Шайтан, И.В. Яминский. Атомно-силовая микроскопия животных клеток: обзор достижений и перспективы развития. Биофизика, 2011, 56, 288-303. [[http://dx.doi.org/10.1134/S0006350911020096|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, J.W. Gerritsen, J.Zivkovic, I.V. Yaminsky, S.Speller. The effect of underlying octadecylamine monolayer on the DNA conformation on the graphite surface. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2010, 76, 63-69. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2009.10.011|DOI]]
  - Е.В. Дубровин, Т.Н. Муругова, К.А. Мотовилов, Л.С. Ягужинский, И.В. Яминский. Применение технологии атомно-силовой микроскопии для структурного анализа внутренней мембраны митохондрий. Российские нанотехнологии, 2009, 4, 156-158. [[http://dx.doi.org/10.1134/S1995078009110160|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, A.G. Voloshin, S.V. Kraevsky, T.E. Ignatyuk, S.S. Abramchuk, I.V. Yaminsky, and S.G. Ignatov. Atomic force microscopy investigation of phage infection of bacteria. Langmuir, 2008, 24, 13068-13074. [[http://dx.doi.org/10.1021/la8022612|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, S.N. Staritsyn, S.A. Yakovenko, I.V. Yaminsky. Self-assembly effect during the adsorption of polynucleotides on stearic acid Langmuir-Blodgett monolayer. Biomacromolecules, 2007, 8, 2258-2261. [[http://dx.doi.org/10.1021/bm0702096|DOI]]
  - E.V. Dubrovin, Yu.F. Drygin, V.K. Novikov, I.V. Yaminsky. Atomic force microscopy as a tool of inspection of viral infection. Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine, 3(2007), 128-131. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.nano.2007.01.005|DOI]]
  - Е.В. Дубpовин, В.Е. Мащенко, В.М. Пузиков, А.В. Семенов, И.В. Яминский. Кооперативный рост тонких пленок тетраэдрического наноуглерода. Доклады Академии Наук, 403, №5, 2005, 649-652. [[http://dx.doi.org/10.1007/s10634-005-0047-y|DOI]]
  - С.Н. Старицын, С.А. Яковенко, А.М. Ломоносов, Е.В. Дубpовин, И.В. Яминский. Межмолекулярное узнавание на полимеризуемых Ленгмюровских монослоях, содержащих нуклеолипиды. Вестник Московского Университета. Физика. Астрономия. № 4, 2005, 49-53. [[http://www.phys.msu.ru/upload/iblock/326/05-4-49.pdf|Полнотекстовая версия (pdf)]]
  - E.V. Dubrovin, I.A. Kirik, M.M. Babykin, I.V. Yaminsky. Atomic force microscopy study of pili in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. In “From Cells to Proteins: Imaging Nature across Dimensions” ed. by Evangelista, V.; Barsanti, L.; Passarelli, V.; Gualtieri, P. Springer, NATO Security Through Science Series, Sub-Series B: Physics and Biophysics, 3, 2005, 405-414. [[http://dx.doi.org/10.1007/1-4020-3616-7|DOI]]
  - Е.В. Дубpовин, М.Н. Кирикова, В.К. Новиков, Ю.Ф. Дрыгин, И.В. Яминский. Изучение особенностей адгезии вируса табачной мозаики методом атомно-силовой микроскопии. Коллоидный журнал. 66 (2004) №6, сс. 750-755. [[http://dx.doi.org/10.1007/s10595-005-0048-x|DOI]]
  - M.A. Skabkin, O.I. Kiselyova, K.G. Chernov, A.V. Sorokin, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.D. Vasiliev and L.P. Ovchinnikov. Structural organization of mRNA complexes with major core mRNP protein YB-1. Nucleic Acids Research, 32 (2004), pp. 5621–5635. [[http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/32/18/5621|Полнотекстовая версия (pdf)]]
  - С.Н. Старицын, В.В. Мамашин, В.В. Захарычев, И.В. Яминский, Е.В. Дубpовин, А.М. Ломоносов, В.А. Твердислов, С.А. Яковенко. Смешанные монослои амфифильных производных азотистых оснований и дииновых кислот. I. Фазовое состояние на границе вода-воздух и в пленках Ленгмюра-Блоджетт. Биофизика. 49 (2004), вып.4, сс. 635-645. [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=15458246&query_hl=1|Abstract]]
  - D.V. Klinov, E.V. Dubrovin, and I.V. Yaminsky. Scanning Probe Microscopy of DNA on Mica and Graphite. AIP Conference Proceedings, 696 (2003), pp. 452-456. [[http://dx.doi.org/10.1063/1.1639735|DOI]]
  - D.V.Klinov, E.V.Dubrovin, I.V.Yaminsky. Substrate for Scanning Probe Microscopy of DNA: HOPG versus mica. Physics of Low-Dimensional Structures, 3-4 (2003), pp. 119-124.
  - A.V.Bolshakova, E.V.Dubrovin, A.S.Filonov, M.O.Gallyamov, D.Yu.Gavrilko, O.I.Kiselyova, A.M.Lomonosov, E.B.Meshkov, I.V.Yaminsky. Open Experimental Internet Practical Studies in Nanoscopy of Polymers and Biomacromolecules. Physics of Low-Dimensional Structures, 3-4 (2003), pp. 113-118.
  - Е.В.Дубpовин, В.Е.Мащенко, В.М.Пузиков, А.В.Семенов, Р.К.Чужко, И.В.Яминский. Рекомбинационное излучение в пленках тетраэдрического наноуглерода. Доклады Академии Наук. 388 (2003) № 4, сс. 497-500. [[http://dx.doi.org/10.1023/A:1022579129422|DOI]]
  - M.O.Gallyamov, E.V.Dubrovin, and I.V.Yaminsky. Micromechanics of Nucleic Acids. Physics of Low-Dimensional Structures, 5-6 (2002), pp. 7-11.
===Список патентов===
  - Способ определения наличия бактерий //Escherichia coli// по детектированию их фрагментов с помощью атомно-силовой микроскопии: патент на изобретение 2437937 Российская Федерация: МПК C12Q 1/00 G01N 13/00 B01D 15/38 / Е.В. Дубровин, Г.Н. Федюкина , С.В. Краевский, Т.Е. Игнатюк , О.Н. Перовская, И.В. Яминский, С.Г. Игнатов; патентообладатель Физический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова. – № 2010116544/10; заявл. 27.04.2010; опубл. 27.12.2011, Бюл. № 36. – 6 с.: 1 ил. [[http://www.fips.ru/cdfi/fips.dll?ty=29&docid=2010116544&cl=9&path=http://195.208.85.248/Archive/PAT/2011FULL/2011.11.10/DOC/RUNWA/000/002/010/116/544/document.pdf|RU 2437937]].
  - Устройство для идентификации последовательностей нуклеотидов: патент на изобретение 2537267 Российская Федерация: МПК C12Q 1/68 / А.С. Ерофеев, И.В. Яминский, Е.В. Дубровин, А.А. Гаскаров, А.И. Иванин, М.Ю. Рубцова, Г.В. Преснова, М.М. Уляшова, В.Г. Григоренко, А.М. Егоров; № 2013130178/10; заявл. 03.07.2013; опубл. 20.05.2014, Бюл. № 14. [[http://www1.fips.ru/wps/portal/IPS_Ru#1504207350923|RU 2537267]].