Здесь показаны различия между выбранной ревизией и текущей версией данной страницы.
евгeний_дубpoвин [2016/07/24 17:58] Евгений Дубровин [Список публикаций] |
евгeний_дубpoвин [2021/03/27 08:58] (текущий) Евгений Дубровин [Список публикаций] |
||
---|---|---|---|
Строка 1: | Строка 1: | ||
====EBГEHИЙ ДУБPOBИH==== | ====EBГEHИЙ ДУБPOBИH==== | ||
- | {{:me9.jpg?200|}}\\ | + | {{:me9.jpg?100|}}\\ |
- | старший научный сотрудник\\ | + | Доктор физ.-мат. наук, 2018\\ |
- | 2003 - окончил физический факультет MГУ имени М.В. Лoмоносова, кафедру биoфизики\\ | + | Ведущий научный сотрудник, кафедра физики полимеров и кристаллов, физический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова\\ |
- | Кандидат физ.-мат. наук, 2005\\ | + | |
**Нaучные интеpесы:** Скaнирующая зoндовая микрoскопия нуклеинoвых кислoт, белкoв, нуклеиновo-белкoвых комплексoв, вирусов и бактерий. Изучение самoорганизации биопoлимеров на поверхнoсти\\ | **Нaучные интеpесы:** Скaнирующая зoндовая микрoскопия нуклеинoвых кислoт, белкoв, нуклеиновo-белкoвых комплексoв, вирусов и бактерий. Изучение самoорганизации биопoлимеров на поверхнoсти\\ | ||
- | **Инoстранные языки:** английский, немецкий\\ | ||
- | **Хoбби:** туpизм, шaхматы, клаcсическая гитaра\\ | ||
**Электронная почта**\\ | **Электронная почта**\\ | ||
{{:addr3.jpg?200 |}}\\ | {{:addr3.jpg?200 |}}\\ | ||
Строка 18: | Строка 15: | ||
Лауреат конкурса грантов Президента РФ для молодых учёных, 2010-2011 и 2013-2014\\ | Лауреат конкурса грантов Президента РФ для молодых учёных, 2010-2011 и 2013-2014\\ | ||
===Список публикаций=== | ===Список публикаций=== | ||
- | - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. Effect of DNA bending on transcriptional interference in the systems of closely spaced convergent promoters. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2016, 1860, 2086–2096. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2016.06.026|DOI]],[[http://authors.elsevier.com/a/1TNvR15Dr~KMNk|personal article link]] | + | - E.V. Dubrovin, L.A. Dadinova, M.V. Petoukhov, E.Yu. Soshinskaya, A.A. Mozhaev, D.V. Klinov, T.E. Schäffer, E.V. Shtykova, O.V. Batishchev. Spatial Organization of Dps and DNA–Dps Complexes. Journal of Molecular Biology, 2021, 166930. [[https://doi.org/10.1016/j.jmb.2021.166930|DOI]] |
- | - N.A. Barinov, V.V. Prokhorov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. AFM visualization at a single-molecule level of denaturated states of proteins on graphite. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2016, 146, 777-784. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2016.07.014|DOI]][[http://authors.elsevier.com/a/1TQ8e3IyxDht2j|personal article link]] | + | - E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, T.E. Schäffer. Evidence of (anti)metamorphic properties of modified graphitic surfaces obtained in real time at a single-molecule level. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2020, 193, 111077. [[https://doi.org/10.1016/j.colsurfb.2020.111077|DOI]] |
+ | - A.P. Tolstova, E.V. Dubrovin. Influence of Pixelization on Height Measurement in Atomic Force Microscopy. Ultramicroscopy, 2019, 207, 112846. [[https://doi.org/10.1016/j.ultramic.2019.112846|DOI]] | ||
+ | - A.S. Erofeev, P.V. Gorelkin, D.V. Kolesov, G.A. Kiselev, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Label-free sensitive detection of influenza virus using PZT discs with a synthetic sialylglycopolymer receptor layer. Royal Society Open Science, 2019, 6, 190255. [[https://doi.org/10.1098/rsos.190255|DOI]] | ||
+ | - E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, T.E. Schäffer, and D.V. Klinov. In Situ Single-Molecule AFM Investigation of Surface-Induced Fibrinogen Unfolding on Graphite. Langmuir, 2019, 35, 9732-9739. [[https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.9b01178|DOI]] | ||
+ | - N.A. Barinov, I.I. Vlasova, A.V. Sokolov, V.A. Kostevich, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. High-resolution atomic force microscopy visualization of metalloproteins and their complexes. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2018, 1862, 2862-2868. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2018.09.008|DOI]] | ||
+ | - A.M. Varizhuk, A.D. Protopopova, V.B. Tsvetkov, N.A. Barinov, V.V. Podgorsky, M.V. Tankevich, M.A. Vlasenok, V.V. Severov, I.P. Smirnov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, G.E. Pozmogova. Polymorphism of G4 associates: from stacks to wires via interlocks. Nucleic Acids Research, 2018, 46, 8978-8992. [[http://dx.doi.org/10.1093/nar/gky729|DOI]] | ||
+ | - E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, D.V. Klinov. High resolution atomic force microscopy visualization of fibrinogen unfolding on modified graphite. Microscopy and Microanalysis, 2018, 24, S1, 1236-1237. [[http://dx.doi.org/10.1017/S1431927618006669|DOI]] | ||
+ | - N.A. Barinov, A.P. Protopopova, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. Thermal denaturation of fibrinogen visualized by single-molecule atomic force microscopy. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2018, 167, 370-376. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2018.04.037|DOI]] | ||
+ | - E.V. Dubrovin, M. Schächtele, D.V. Klinov, and T.E. Schäffer. Time-lapsed single biomolecule atomic force microscopy investigation on modified graphite in solution. Langmuir, 2017, 33, 10027-10034. [[http://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.7b02220|DOI]] | ||
+ | - E.V. Dubrovin, M. Schächtele, and T.E. Schäffer. Nanotemplate-directed DNA segmental thermal motion. RSC Advances, 2016, 6, 79584-79592. [[http://dx.doi.org/10.1039/C6RA14383K|DOI]] | ||
+ | - N.A. Barinov, V.V. Prokhorov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. AFM visualization at a single-molecule level of denaturated states of proteins on graphite. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2016, 146, 777-784. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.colsurfb.2016.07.014|DOI]] | ||
+ | - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. Effect of DNA bending on transcriptional interference in the systems of closely spaced convergent promoters. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2016, 1860, 2086–2096. [[http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2016.06.026|DOI]] | ||
- O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, A.P. Tolstova, N.V. Kuzmina, T.V. Laptinskaya, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. A hypothetical hierarchical mechanism of self-assembly of Escherichia coli RNA polymerase σ<sup>70</sup> subunit. Soft Matter, 2016, 12, 1974-1982. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5SM02934A|DOI]] | - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, A.P. Tolstova, N.V. Kuzmina, T.V. Laptinskaya, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. A hypothetical hierarchical mechanism of self-assembly of Escherichia coli RNA polymerase σ<sup>70</sup> subunit. Soft Matter, 2016, 12, 1974-1982. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5SM02934A|DOI]] | ||
- P.V. Gorelkin, A.S. Erofeev, G.A. Kiselev, D.V. Kolesov, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Synthetic sialylglycopolymer receptor for virus detection using cantilever-based sensors. The Analyst, 2015, 140, 6131-6137. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5AN01102G|DOI]] | - P.V. Gorelkin, A.S. Erofeev, G.A. Kiselev, D.V. Kolesov, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Synthetic sialylglycopolymer receptor for virus detection using cantilever-based sensors. The Analyst, 2015, 140, 6131-6137. [[http://dx.doi.org/10.1039/C5AN01102G|DOI]] | ||
+ | - А.П. Толстова, Е.В. Дубровин, О.Н. Королёва. Исследование зависимости структуры σ<sup>70</sup>-субъединицы РНК-полимеразы //Escherichia coli// от ионной силы методом молекулярной динамики. Биофизика, 2015, 60, 1045–1049. [[http://dx.doi.org/10.1134/S0006350915060251|DOI]] | ||
- Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, А.М. Егоров, В.Г. Григоренко, И.В. Яминский. Применение атомно-силовой микроскопии для 3D-анализа результатов гибридизации нуклеиновых кислот на микрочипах. Acta naturae, 2015, 7, 117-124. [[http://www.actanaturae.ru/attachment.aspx?id=2135|PDF]] | - Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, А.М. Егоров, В.Г. Григоренко, И.В. Яминский. Применение атомно-силовой микроскопии для 3D-анализа результатов гибридизации нуклеиновых кислот на микрочипах. Acta naturae, 2015, 7, 117-124. [[http://www.actanaturae.ru/attachment.aspx?id=2135|PDF]] | ||
- E.V. Dubrovin, S. Speller, I.V. Yaminsky. Statistical analysis of molecular nanotemplate driven DNA adsorption on graphite. Langmuir, 2014, 30, 15423–15432. [[http://dx.doi.org/10.1021/la5041773|DOI]] | - E.V. Dubrovin, S. Speller, I.V. Yaminsky. Statistical analysis of molecular nanotemplate driven DNA adsorption on graphite. Langmuir, 2014, 30, 15423–15432. [[http://dx.doi.org/10.1021/la5041773|DOI]] | ||
+ | - Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, В.Г. Григоренко, А.И. Иванин, А.М. Егоров, И.В. Яминский. Применение сканирующей зондовой микроскопии в решении задач молекулярной диагностики. Биомедицинская химия, 2014, 60, 543-547. | ||
- O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. The Model of Amyloid Aggregation of //Escherichia coli// RNA Polymerase σ<sup>70</sup> Subunit Based on AFM Data and In Vitro Assays. Cell Biochemistry and Biophysics, 2013, 66, 623-636. [[http://dx.doi.org/10.1007/s12013-012-9507-2|DOI]] | - O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. The Model of Amyloid Aggregation of //Escherichia coli// RNA Polymerase σ<sup>70</sup> Subunit Based on AFM Data and In Vitro Assays. Cell Biochemistry and Biophysics, 2013, 66, 623-636. [[http://dx.doi.org/10.1007/s12013-012-9507-2|DOI]] | ||
- E.V. Dubrovin, A.V. Popova, S.V. Kraevskiy, S.G. Ignatov, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky, N.V. Volozhantsev. Atomic Force Microscopy Analysis of the //Acinetobacter baumannii// Bacteriophage AP22 Lytic Cycle. PLOS ONE, 2012, 7(10): e47348. [[http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0047348|DOI]] | - E.V. Dubrovin, A.V. Popova, S.V. Kraevskiy, S.G. Ignatov, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky, N.V. Volozhantsev. Atomic Force Microscopy Analysis of the //Acinetobacter baumannii// Bacteriophage AP22 Lytic Cycle. PLOS ONE, 2012, 7(10): e47348. [[http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0047348|DOI]] | ||
Строка 48: | Строка 58: | ||
- M.O.Gallyamov, E.V.Dubrovin, and I.V.Yaminsky. Micromechanics of Nucleic Acids. Physics of Low-Dimensional Structures, 5-6 (2002), pp. 7-11. | - M.O.Gallyamov, E.V.Dubrovin, and I.V.Yaminsky. Micromechanics of Nucleic Acids. Physics of Low-Dimensional Structures, 5-6 (2002), pp. 7-11. | ||
===Список патентов=== | ===Список патентов=== | ||
- | - Способ определения наличия бактерий //Escherichia coli// по детектированию их фрагментов с помощью атомно-силовой микроскопии: патент на изобретение 2437937 Российская Федерация: МПК C12Q 1/00 G01N 13/00 B01D 15/38 / Е.В. Дубровин, Г.Н. Федюкина , С.В. Краевский, Т.Е. Игнатюк , О.Н. Перовская, И.В. Яминский, С.Г. Игнатов; патентообладатель Физический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова. – № 2010116544/10; заявл. 27.04.2010; опубл. 27.12.2011, Бюл. № 36. – 6 с.: 1 ил. [[http://www.fips.ru/cdfi/fips.dll?ty=29&docid=2010116544&cl=9&path=http://195.208.85.248/Archive/PAT/2011FULL/2011.11.10/DOC/RUNWA/000/002/010/116/544/document.pdf|RU 2437937]]. | + | - Способ определения наличия бактерий //Escherichia coli// по детектированию их фрагментов с помощью атомно-силовой микроскопии: патент на изобретение 2437937 Российская Федерация: МПК C12Q 1/00 G01N 13/00 B01D 15/38 / Е.В. Дубровин, Г.Н. Федюкина , С.В. Краевский, Т.Е. Игнатюк , О.Н. Перовская, И.В. Яминский, С.Г. Игнатов; патентообладатель Физический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова. – № 2010116544/10; заявл. 27.04.2010; опубл. 27.12.2011, Бюл. № 36. – 6 с.: 1 ил. [[http://www.fips.ru/cdfi/fips.dll?ty=29&docid=2010116544&cl=9&path=http://195.208.85.248/Archive/PAT/2011FULL/2011.11.10/DOC/RUNWA/000/002/010/116/544/document.pdf|RU 2437937]] |
+ | - Устройство для идентификации последовательностей нуклеотидов: патент на изобретение 2537267 Российская Федерация: МПК C12Q 1/68 / А.С. Ерофеев, И.В. Яминский, Е.В. Дубровин, А.А. Гаскаров, А.И. Иванин, М.Ю. Рубцова, Г.В. Преснова, М.М. Уляшова, В.Г. Григоренко, А.М. Егоров; № 2013130178/10; заявл. 03.07.2013; опубл. 20.05.2014, Бюл. № 14. [[http://www1.fips.ru/wps/portal/IPS_Ru#1504207350923|RU 2537267]]. |