Содержание

EBГEHИЙ ДУБPOBИH


Доктор физ.-мат. наук, 2018
Ведущий научный сотрудник, кафедра физики полимеров и кристаллов, физический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова
Нaучные интеpесы: Скaнирующая зoндовая микрoскопия нуклеинoвых кислoт, белкoв, нуклеиновo-белкoвых комплексoв, вирусов и бактерий. Изучение самoорганизации биопoлимеров на поверхнoсти
Электронная почта

Нaгpады:

Лауреат конкурса «Грант Москвы - 2001» в области естественных наук
Cтипендия Президента РФ для аспирантов - 2004/2005
Лауреат конкурса «Грант Москвы - 2005» в области наук и технологий в сфере образования
Стипендия компании LG Chem для аспирантов - 2006
Премия Европейской Академии для молодых российских учёных, 2009
Стипендия Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, 2010, 2012, 2013
Лауреат конкурса грантов Президента РФ для молодых учёных, 2010-2011 и 2013-2014

Список публикаций

  1. E.V. Dubrovin, L.A. Dadinova, M.V. Petoukhov, E.Yu. Soshinskaya, A.A. Mozhaev, D.V. Klinov, T.E. Schäffer, E.V. Shtykova, O.V. Batishchev. Spatial Organization of Dps and DNA–Dps Complexes. Journal of Molecular Biology, 2021, 166930. DOI
  2. E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, T.E. Schäffer. Evidence of (anti)metamorphic properties of modified graphitic surfaces obtained in real time at a single-molecule level. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2020, 193, 111077. DOI
  3. A.P. Tolstova, E.V. Dubrovin. Influence of Pixelization on Height Measurement in Atomic Force Microscopy. Ultramicroscopy, 2019, 207, 112846. DOI
  4. A.S. Erofeev, P.V. Gorelkin, D.V. Kolesov, G.A. Kiselev, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Label-free sensitive detection of influenza virus using PZT discs with a synthetic sialylglycopolymer receptor layer. Royal Society Open Science, 2019, 6, 190255. DOI
  5. E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, T.E. Schäffer, and D.V. Klinov. In Situ Single-Molecule AFM Investigation of Surface-Induced Fibrinogen Unfolding on Graphite. Langmuir, 2019, 35, 9732-9739. DOI
  6. N.A. Barinov, I.I. Vlasova, A.V. Sokolov, V.A. Kostevich, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. High-resolution atomic force microscopy visualization of metalloproteins and their complexes. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2018, 1862, 2862-2868. DOI
  7. A.M. Varizhuk, A.D. Protopopova, V.B. Tsvetkov, N.A. Barinov, V.V. Podgorsky, M.V. Tankevich, M.A. Vlasenok, V.V. Severov, I.P. Smirnov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov, G.E. Pozmogova. Polymorphism of G4 associates: from stacks to wires via interlocks. Nucleic Acids Research, 2018, 46, 8978-8992. DOI
  8. E.V. Dubrovin, N.A. Barinov, D.V. Klinov. High resolution atomic force microscopy visualization of fibrinogen unfolding on modified graphite. Microscopy and Microanalysis, 2018, 24, S1, 1236-1237. DOI
  9. N.A. Barinov, A.P. Protopopova, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. Thermal denaturation of fibrinogen visualized by single-molecule atomic force microscopy. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2018, 167, 370-376. DOI
  10. E.V. Dubrovin, M. Schächtele, D.V. Klinov, and T.E. Schäffer. Time-lapsed single biomolecule atomic force microscopy investigation on modified graphite in solution. Langmuir, 2017, 33, 10027-10034. DOI
  11. E.V. Dubrovin, M. Schächtele, and T.E. Schäffer. Nanotemplate-directed DNA segmental thermal motion. RSC Advances, 2016, 6, 79584-79592. DOI
  12. N.A. Barinov, V.V. Prokhorov, E.V. Dubrovin, D.V. Klinov. AFM visualization at a single-molecule level of denaturated states of proteins on graphite. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2016, 146, 777-784. DOI
  13. O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. Effect of DNA bending on transcriptional interference in the systems of closely spaced convergent promoters. Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, 2016, 1860, 2086–2096. DOI
  14. O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, A.P. Tolstova, N.V. Kuzmina, T.V. Laptinskaya, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. A hypothetical hierarchical mechanism of self-assembly of Escherichia coli RNA polymerase σ70 subunit. Soft Matter, 2016, 12, 1974-1982. DOI
  15. P.V. Gorelkin, A.S. Erofeev, G.A. Kiselev, D.V. Kolesov, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky. Synthetic sialylglycopolymer receptor for virus detection using cantilever-based sensors. The Analyst, 2015, 140, 6131-6137. DOI
  16. А.П. Толстова, Е.В. Дубровин, О.Н. Королёва. Исследование зависимости структуры σ70-субъединицы РНК-полимеразы Escherichia coli от ионной силы методом молекулярной динамики. Биофизика, 2015, 60, 1045–1049. DOI
  17. Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, А.М. Егоров, В.Г. Григоренко, И.В. Яминский. Применение атомно-силовой микроскопии для 3D-анализа результатов гибридизации нуклеиновых кислот на микрочипах. Acta naturae, 2015, 7, 117-124. PDF
  18. E.V. Dubrovin, S. Speller, I.V. Yaminsky. Statistical analysis of molecular nanotemplate driven DNA adsorption on graphite. Langmuir, 2014, 30, 15423–15432. DOI
  19. Е.В. Дубровин, Г.В. Преснова, М.Ю. Рубцова, В.Г. Григоренко, А.И. Иванин, А.М. Егоров, И.В. Яминский. Применение сканирующей зондовой микроскопии в решении задач молекулярной диагностики. Биомедицинская химия, 2014, 60, 543-547.
  20. O.N. Koroleva, E.V. Dubrovin, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. The Model of Amyloid Aggregation of Escherichia coli RNA Polymerase σ70 Subunit Based on AFM Data and In Vitro Assays. Cell Biochemistry and Biophysics, 2013, 66, 623-636. DOI
  21. E.V. Dubrovin, A.V. Popova, S.V. Kraevskiy, S.G. Ignatov, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky, N.V. Volozhantsev. Atomic Force Microscopy Analysis of the Acinetobacter baumannii Bacteriophage AP22 Lytic Cycle. PLOS ONE, 2012, 7(10): e47348. DOI
  22. E.V. Dubrovin, O.N. Koroleva, Yu.A. Khodak, N.V. Kuzmina, I.V. Yaminsky, V.L. Drutsa. AFM study of Escherichia coli RNA polymerase σ70 subunit aggregation. Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine, 2012, 8, 54-62. DOI
  23. E.V. Dubrovin, G.N. Fedyukina, S.V. Kraevsky, T.E. Ignatyuk, I.V. Yaminsky and S.G. Ignatov. AFM Specific Identification of Bacterial Cell Fragments on Biofunctional Surfaces. The Open Microbiology Journal, 2012, 6, 22-28. DOI
  24. М.В. Архипенко, Е.К. Петрова, Н.А. Никитин, А.Д. Протопопова, Е.В. Дубpовин, И.В. Яминский, Н.П. Родионова, О.В. Карпова, И.Г. Атабеков. Искусственные вирусоподобные частицы, полученные in vitro из белка оболочки Х-вируса картофеля и чужеродных вирусных РНК. Acta Naturae, 2011, 3, 47-53. Полнотекстовая версия (pdf)
  25. И.В. Яминский, П.В. Горелкин, Е.В. Дубpовин. Наноаналитика для медицины. Биофизика, 2011, 56, 955-960.
  26. Ю.М. Ефремов, Д.В. Багров, Е.В. Дубpовин, К.В. Шайтан, И.В. Яминский. Атомно-силовая микроскопия животных клеток: обзор достижений и перспективы развития. Биофизика, 2011, 56, 288-303. DOI
  27. E.V. Dubrovin, J.W. Gerritsen, J.Zivkovic, I.V. Yaminsky, S.Speller. The effect of underlying octadecylamine monolayer on the DNA conformation on the graphite surface. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, 2010, 76, 63-69. DOI
  28. Е.В. Дубровин, Т.Н. Муругова, К.А. Мотовилов, Л.С. Ягужинский, И.В. Яминский. Применение технологии атомно-силовой микроскопии для структурного анализа внутренней мембраны митохондрий. Российские нанотехнологии, 2009, 4, 156-158. DOI
  29. E.V. Dubrovin, A.G. Voloshin, S.V. Kraevsky, T.E. Ignatyuk, S.S. Abramchuk, I.V. Yaminsky, and S.G. Ignatov. Atomic force microscopy investigation of phage infection of bacteria. Langmuir, 2008, 24, 13068-13074. DOI
  30. E.V. Dubrovin, S.N. Staritsyn, S.A. Yakovenko, I.V. Yaminsky. Self-assembly effect during the adsorption of polynucleotides on stearic acid Langmuir-Blodgett monolayer. Biomacromolecules, 2007, 8, 2258-2261. DOI
  31. E.V. Dubrovin, Yu.F. Drygin, V.K. Novikov, I.V. Yaminsky. Atomic force microscopy as a tool of inspection of viral infection. Nanomedicine: Nanotechnology, Biology and Medicine, 3(2007), 128-131. DOI
  32. Е.В. Дубpовин, В.Е. Мащенко, В.М. Пузиков, А.В. Семенов, И.В. Яминский. Кооперативный рост тонких пленок тетраэдрического наноуглерода. Доклады Академии Наук, 403, №5, 2005, 649-652. DOI
  33. С.Н. Старицын, С.А. Яковенко, А.М. Ломоносов, Е.В. Дубpовин, И.В. Яминский. Межмолекулярное узнавание на полимеризуемых Ленгмюровских монослоях, содержащих нуклеолипиды. Вестник Московского Университета. Физика. Астрономия. № 4, 2005, 49-53. Полнотекстовая версия (pdf)
  34. E.V. Dubrovin, I.A. Kirik, M.M. Babykin, I.V. Yaminsky. Atomic force microscopy study of pili in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. In “From Cells to Proteins: Imaging Nature across Dimensions” ed. by Evangelista, V.; Barsanti, L.; Passarelli, V.; Gualtieri, P. Springer, NATO Security Through Science Series, Sub-Series B: Physics and Biophysics, 3, 2005, 405-414. DOI
  35. Е.В. Дубpовин, М.Н. Кирикова, В.К. Новиков, Ю.Ф. Дрыгин, И.В. Яминский. Изучение особенностей адгезии вируса табачной мозаики методом атомно-силовой микроскопии. Коллоидный журнал. 66 (2004) №6, сс. 750-755. DOI
  36. M.A. Skabkin, O.I. Kiselyova, K.G. Chernov, A.V. Sorokin, E.V. Dubrovin, I.V. Yaminsky, V.D. Vasiliev and L.P. Ovchinnikov. Structural organization of mRNA complexes with major core mRNP protein YB-1. Nucleic Acids Research, 32 (2004), pp. 5621–5635. Полнотекстовая версия (pdf)
  37. С.Н. Старицын, В.В. Мамашин, В.В. Захарычев, И.В. Яминский, Е.В. Дубpовин, А.М. Ломоносов, В.А. Твердислов, С.А. Яковенко. Смешанные монослои амфифильных производных азотистых оснований и дииновых кислот. I. Фазовое состояние на границе вода-воздух и в пленках Ленгмюра-Блоджетт. Биофизика. 49 (2004), вып.4, сс. 635-645. Abstract
  38. D.V. Klinov, E.V. Dubrovin, and I.V. Yaminsky. Scanning Probe Microscopy of DNA on Mica and Graphite. AIP Conference Proceedings, 696 (2003), pp. 452-456. DOI
  39. D.V.Klinov, E.V.Dubrovin, I.V.Yaminsky. Substrate for Scanning Probe Microscopy of DNA: HOPG versus mica. Physics of Low-Dimensional Structures, 3-4 (2003), pp. 119-124.
  40. A.V.Bolshakova, E.V.Dubrovin, A.S.Filonov, M.O.Gallyamov, D.Yu.Gavrilko, O.I.Kiselyova, A.M.Lomonosov, E.B.Meshkov, I.V.Yaminsky. Open Experimental Internet Practical Studies in Nanoscopy of Polymers and Biomacromolecules. Physics of Low-Dimensional Structures, 3-4 (2003), pp. 113-118.
  41. Е.В.Дубpовин, В.Е.Мащенко, В.М.Пузиков, А.В.Семенов, Р.К.Чужко, И.В.Яминский. Рекомбинационное излучение в пленках тетраэдрического наноуглерода. Доклады Академии Наук. 388 (2003) № 4, сс. 497-500. DOI
  42. M.O.Gallyamov, E.V.Dubrovin, and I.V.Yaminsky. Micromechanics of Nucleic Acids. Physics of Low-Dimensional Structures, 5-6 (2002), pp. 7-11.

Список патентов

  1. Способ определения наличия бактерий Escherichia coli по детектированию их фрагментов с помощью атомно-силовой микроскопии: патент на изобретение 2437937 Российская Федерация: МПК C12Q 1/00 G01N 13/00 B01D 15/38 / Е.В. Дубровин, Г.Н. Федюкина , С.В. Краевский, Т.Е. Игнатюк , О.Н. Перовская, И.В. Яминский, С.Г. Игнатов; патентообладатель Физический факультет Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова. – № 2010116544/10; заявл. 27.04.2010; опубл. 27.12.2011, Бюл. № 36. – 6 с.: 1 ил. RU 2437937
  2. Устройство для идентификации последовательностей нуклеотидов: патент на изобретение 2537267 Российская Федерация: МПК C12Q 1/68 / А.С. Ерофеев, И.В. Яминский, Е.В. Дубровин, А.А. Гаскаров, А.И. Иванин, М.Ю. Рубцова, Г.В. Преснова, М.М. Уляшова, В.Г. Григоренко, А.М. Егоров; № 2013130178/10; заявл. 03.07.2013; опубл. 20.05.2014, Бюл. № 14. RU 2537267.