Для упорядочивания окон предназначены команды Cascade и Tile из меню Window. По команде Cascade окна будут расположены одно под другим по диагонали от левого верхнего угла. По команде Tile окна располагаются не перекрываясь, следуя друг за другом слева направо и сверху вниз.
Если в рабочей области программы есть свернутые окна, то после команды меню Windows/ Arrange Icons их заголовки будут расположены вплотную друг за другом слева направо и снизу вверх начиная из левого нижнего угла.
Если вы хотите закрыть все окна (и видимые, и свернутые), выберите команду Close All того же меню.